同日よりシャープが配布開始したアプリケーション「GALAPAGOS App for Smartphone」をシャープ製スマートフォンにインストールすることで、電子ブックの購入、管理・閲覧が可能となる。定期購読サービスにも対応する。また、すでにメディアタブレットGALAPAGOSを利用しているユーザであれば、スマートフォンの「GALAPAGOS App for Smartphone」に同じユーザーIDでログインし、購入済みのコンテンツを閲覧することもできる。
また「GALAPAGOS App for Smartphone」は「横Fit」モードを搭載しており、横向きにした際の見開き画面時のメニューから「横Fit」を選択すると、横サイズに最適化した形で誌面が表示される。ホーム画面「デスク」では、新着の本は「未読・おすすめ」、読みかけの本は「最近読んだ本」、よく読む本は「お気に入り」、定期購読の雑誌等はバックナンバーも含めて「定期購読」に分類して整理される。
アプリはAndroidマーケット、シャープのポータルサイト「GALAPAGOS SQUARE」からダウンロード可能。現在の対応端末は、IS03、IS05(au)、LYNX 3D SH-03C(ドコモ)、GALAPAGOS SoftBank 003SH、GALAPAGOS SoftBank 005SH(ソフトバンク)、DM009SH(ディズニー・モバイル)となる。