AE/AF性能においては新たなAEシステムを採用。10万画素のRGB測光センサーと「DIGIC 4」を組み合わせ、明るさだけでなく被写体の顔や色の認識が可能となった。また、従来機種「EOS-1D Mark IV」(2009年12月発売)のF2.8測距と同等の精度を持つF4.0対応の測距センサーを採用。これを20点配置した総測距点数61点の新AFセンサーを搭載し、被写体の捕捉率とピント合わせの精度が向上したという。さらに、新AEシステムと新AFセンサーの連携で、被写体の顔や色を追尾してピントを合わせ続けられるようになった。